周四发表在《科学公共图书馆·病原体》杂志上的一篇论文称,英国肯特大学的研究人员运用保护科学(conservation science)的模型估计,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)早在2019年10月初至11月中旬就在中国出现。他们估计,病毒最有可能出现的日期是2019年11月17日,到2020年1月,它可能已经在全球传播了。澳大利亚柯比研究所副教授斯图尔特·特维尔对该研究表示,仍需检测血清样本才能更有力地证明SARS-CoV-2的起源。“不幸的是,鉴于目前实验室泄漏假说的压力,以及在中国进行后续研究的敏感性,我们可能需要一段时间才能看到这样的报告”。
中国第一例官方公布的新型肺炎病例发生在2019年12月,与武汉华南海鲜市场有关。然而,一些早期病例与华南海鲜市场没有已知的联系,这意味着SARS-CoV-2在进入该市场之前就已经在传播了。
大约一年前,来自武汉新型肺炎早期病例的200多个病毒样本的基因序列从美国政府的国家医学图书馆管理的一个数据库中消失。美国国立卫生研究院证实,研究中使用的样本已于2020年3月提交给序列读取档案(Sequence Read Archive,SRA),后来在2020年6月应中国研究人员的要求,在去年夏天删除,中国研究人员称将对其进行更新并提交给另一个数据库。西雅图弗雷德·哈钦森癌症研究中心的杰西·布卢姆在本周发表的一篇预印本论文中报告说,通过对存储在谷歌云上的文件进行分析,他已经恢复了其中的13个原始序列。布卢姆将这13个序列与其他已发表的早期冠状病毒序列结合,希望在构建SARS-CoV-2病毒族谱方面取得进展。对于中国研究人员所说的会更新提交的说法,布卢姆表示,已经搜索了他知道的每一个数据库,都没有找到。
华南海鲜市场上的病毒实际上有三种额外的突变,而这些突变在几周后收集的SARS-CoV-2样本中是缺失的。后者看起来更像在蝙蝠身上发现的冠状病毒,这支持了这种病毒的一些早期谱系没有经过海鲜市场的观点。布卢姆发现,恢复的被删除序列也没有这些额外的突变。“它们与蝙蝠冠状病毒的相似度比华南海鲜市场的病毒高三倍”。这表明当SARS-CoV-2进入市场时,它已经在武汉或其他地方传播了一段时间。他认为,市场的病毒并不代表2019年底已经传播开来的冠状病毒的全部多样性,“也许我们根据测序得出的情况和武汉早期存在的情况可能有些偏差”。不过,布卢姆在他的报告中承认,必须通过对病毒序列的更深入分析来证实这一结论。
在《科学报告》杂志周四发表的另一项研究中,澳大利亚科学家利用基因组数据显示,SARS-CoV-2比其他物种更容易与人类受体结合,这表明当SARS-CoV-2首次出现时,它已经适应了人类。有可能还有另一种亲和力更强的不明动物作为中间物种,但不能排除它是从实验室泄露出来的假设。世界卫生组织新型冠状病毒溯源研究国际专家组成员、澳大利亚韦斯特米德医院传染病专家多米尼克·德怀尔说,“虽然很明显早期病毒对人类受体有很高的趋向性,但这并不意味着它们是‘人为的’。这样的结论仍然是猜测”。
(路透社,纽约时报,科学公共图书馆·病原体)
中国第一例官方公布的新型肺炎病例发生在2019年12月,与武汉华南海鲜市场有关。然而,一些早期病例与华南海鲜市场没有已知的联系,这意味着SARS-CoV-2在进入该市场之前就已经在传播了。
大约一年前,来自武汉新型肺炎早期病例的200多个病毒样本的基因序列从美国政府的国家医学图书馆管理的一个数据库中消失。美国国立卫生研究院证实,研究中使用的样本已于2020年3月提交给序列读取档案(Sequence Read Archive,SRA),后来在2020年6月应中国研究人员的要求,在去年夏天删除,中国研究人员称将对其进行更新并提交给另一个数据库。西雅图弗雷德·哈钦森癌症研究中心的杰西·布卢姆在本周发表的一篇预印本论文中报告说,通过对存储在谷歌云上的文件进行分析,他已经恢复了其中的13个原始序列。布卢姆将这13个序列与其他已发表的早期冠状病毒序列结合,希望在构建SARS-CoV-2病毒族谱方面取得进展。对于中国研究人员所说的会更新提交的说法,布卢姆表示,已经搜索了他知道的每一个数据库,都没有找到。
华南海鲜市场上的病毒实际上有三种额外的突变,而这些突变在几周后收集的SARS-CoV-2样本中是缺失的。后者看起来更像在蝙蝠身上发现的冠状病毒,这支持了这种病毒的一些早期谱系没有经过海鲜市场的观点。布卢姆发现,恢复的被删除序列也没有这些额外的突变。“它们与蝙蝠冠状病毒的相似度比华南海鲜市场的病毒高三倍”。这表明当SARS-CoV-2进入市场时,它已经在武汉或其他地方传播了一段时间。他认为,市场的病毒并不代表2019年底已经传播开来的冠状病毒的全部多样性,“也许我们根据测序得出的情况和武汉早期存在的情况可能有些偏差”。不过,布卢姆在他的报告中承认,必须通过对病毒序列的更深入分析来证实这一结论。
在《科学报告》杂志周四发表的另一项研究中,澳大利亚科学家利用基因组数据显示,SARS-CoV-2比其他物种更容易与人类受体结合,这表明当SARS-CoV-2首次出现时,它已经适应了人类。有可能还有另一种亲和力更强的不明动物作为中间物种,但不能排除它是从实验室泄露出来的假设。世界卫生组织新型冠状病毒溯源研究国际专家组成员、澳大利亚韦斯特米德医院传染病专家多米尼克·德怀尔说,“虽然很明显早期病毒对人类受体有很高的趋向性,但这并不意味着它们是‘人为的’。这样的结论仍然是猜测”。
(路透社,纽约时报,科学公共图书馆·病原体)